医院信息系统是最复杂的企业级信息系统之一，它不但伴随着人流、物流、财流的管理信息，同时也是支持以病人为中心的整个医疗、教学、科研的各种活动。它的发展特点体现在三个方面：
1、是以管理为中心，主要满足服务管理层的需要；
2、以临床为中心；主要是满足医、护、剂、经管等各业务科室的需要；
3、以服务病人为中心，是满足患者为前题的。
对任何医院来说，信息化建设都会经历一个过程，这是管理理念的转变，也是管理思路和手段的转变。医院信息主管网认为由以上3个发展特点决定了医院信息化建设要面临的六大问题，这几个问题都在不同程度地限制着医疗信息化的发展。
一、 国家政策与信息安全
医院信息化的建设不仅是技术问题，同时也是一个经济问题和社会问题。技术问题的解决必然要与有关的经济、社会问题相联系、相结合。发展网络经济，推进信息化，离不开好的宏观环境。医院信息化不仅需要政府的努力，更需要各级医疗卫生部门的参与。
1、目前中国推行的各种制度往往具有各自为政的特点，相互之间缺少统一性和协调性，具体做法也大不一样，或者是单个制度缺乏互动性、可操作性，致使各地方、各部门在实际运行过程中存在较大的差异，无法规可依，
2、比如，医疗信息的公开问题，包括医院账务、医疗手段、患者个人的隐私保密等问题，致使医院资源共享问题复杂化，如果这些关系不能较好处理，公众医疗信息网的建设也是空想，甚至会造成更混乱的局面。贯彻医疗信息透明度原则，最为重要的是处理好公开与保密的关系，科学地界定公开与保密的关系 ，客观地解决医疗内部经营机制，建立健全相关医疗法规，规范医疗行为，设立权威性的机构统一协调医院信息公开政策等。
3、另外还应制定信息安全、个人数据保护、电子签名（明年4月份实施）、电子商务、公文控制、病人健康信息隐私保护与信息安全、医疗保险和医疗电子商务、医学信息标准化（分类与编码）等一批相配套的法律、法规。
4、其中信息安全存在更为严重的隐患，没有统一的开发标准，也没有统一的安全防范体系，它也制约着整个医院信息化建设的进程，相对于应用程序来说，安全技术太过于落后，也没有统一的开发标准，加上网络的飞速发展，我们所应用的系统时刻都在受着安全的威胁。而我们又不得不面临不断变化的业务环境、应用程序的开发技术、应用平台、网络环境对安全提出的挑战。相对医院应用的特殊性和时效性，我们要建立何种机制，何种有效的、灵活的安全体系结构，来保护其复杂的应用和资源，是医院信息主管们思考的重点。